[1]孙崇蕊,张明杰,徐卓明..单心室患儿肠道菌群结构特征分析[J].临床小儿外科杂志,2018,17(08):620-625.
　Sun Chongrui,Zhang Mingjie,Xu Zhuoming..Structure of gut microbiota in children with single ventricle physiology.[J].Journal of Clinical Pediatric Surgery,2018,17(08):620-625.
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单心室患儿肠道菌群结构特征分析

《临床小儿外科杂志》[ISSN:1671-6353/CN:43-1380/R] 卷: 第17卷 期数: 2018年08期 页码: 620-625 栏目: 实验研究 出版日期: 2018-08-28
Title:
Structure of gut microbiota in children with single ventricle physiology.
作者:
孙崇蕊; 张明杰 ; 徐卓明.
上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心心胸外科 undefined
Author(s):
Sun Chongrui; Zhang Mingjie; Xu Zhuoming.
Department of Cardiothoracic Surgery,Shanghai Children’s Medical Center,Shanghai Jiao Tong University School of Medicine,Shanghai 200127,China.
关键词:
单心室; 心脏病／先天性; 肠道菌群; 高通量测序
Keywords:
Single Ventricle;  Heart Diseasea/CN;  Gut Microbiota;  Highthroughput sequencing
文献标志码:
A
摘要:
目 的 　通 过 Ｉｌｌｕｍｉｎａ 高 通 量 测 序 技 术 提 取 单 心 室 和 双 心 室 患 儿 粪 便 样 本 中 细 菌 总 ＤＮＡ，比 较 两 组 患 儿 肠 道 菌 群 的 异 同 。 　 方 法 　 选 取 在 本 院 行 全 腔 静 脉 肺 动 脉 连 接 术 的 单 心 室 患 儿 ２０ 例（ 男 １１ 例 ， 女 ９ 例 ， 年 龄 ３ ～１０ 岁 ） 作 为 单 心 室 组 ， 选 取 同 期 在 本 院 性 别 相 同 、 年 龄 （ ±１ 岁 ） 相 匹 配 的 双心 室 患 儿 作 为 双 心 室 组 ， 收 集 患 儿 粪 便 标 本 并 提 取 样 本 中 细 菌 的 ＤＮＡ， 进 行 １６Ｓ ｒＲＮＡ 高 通 量 测 序 ， 获得 肠 道 菌 群 结 构 数 据 。 　结 果 　在 ＯＴＵ（ ｏｐｅｒａｔｉｏｎａｌ ｔａｘｏｎｏｍｉｃ ｕｎｉｔｓ） 水 平 上 ， 单 心 室 组 和 双心 室 组 的 丰富 度 指 数 （ Ａｃｅ： １９０． ８８ ｖｓ． ２０１． ２８ 和 Ｃｈｏ： １８８． ２７ ｖｓ． ２０１． ９０） 、 多 样 性 指 数 （ Ｓｈａｎｎｏｎ：３． １４０ ｖｓ． ３． ０９０ 和Ｓｉｍｐｓｏｎ： ０． １０９ ｖｓ． ０． １１０） 、 覆 盖 率 指 数 （ Ｃｏｖｅｒａｇｅ： ０． ９９９ ｖｓ． ０． ９９９） 差 异 均 无 统 计 学 意 义 （ Ｐ ＞０． ０５） 。 门水 平 上 两 组 均 以 厚 壁 菌 门 、 拟 杆 菌 门 、 变 形 菌 门 、 放 线 菌 门 为 主 要 优 势 菌 群 ， 其 中 蓝 细 菌 门 构 成 比 存 在 统计 学 差 异 （ Ｐ ＜０． ０５） 。 在 属 水 平 上 ， 两 组 共 检 测 到 ２２４ 种 不 同 菌 属 ， 其 中 柔 嫩 梭 菌 属 （ ９． ５５％ ｖ４．
９１％） ， 韦 荣 氏 球 菌 属 （ ３． ０８％ ｖｓ． ０． ５０％） ， Ｌａｃｈｎｏｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ（ １． ０２％ ｖｓ． ２．２％） ， 罗 斯 伯 里 氏 菌 属 （ ０．６２％ ｖｓ． ２． ５１％） ， 嗜 胆 菌 属 （ ０． ２５％ ｖｓ． ０． ０５％） ， 放 线 菌 属 （ ０． ３１２％ ｖｓ． ０． ００８％） 等 菌 属 的 构 成 比 存 在统 计 学 差 异 （ Ｐ ＜０． ０５） 。 　结 论 　单 心 室 患 儿 与 双 心 室 患 儿 相 比 ， 菌 群 多 样 性 指 数 无 明 显 差 异 ， 但 是 菌群 结 构 上 发 生 了 一 些 变 化 ， 在 门 水 平 、 属 水 平 均 存 在 差 异 。
Abstract:
ObjectiveTotal DNA of stool samples was extracted from children with single and biventricle physiology by Illumina highthroughput sequencing technology and the differences of intestinal microbiota between two groups were compared.MethodsTwenty cases of singleventricle children (11 males,9 females,age of 3~10 years) undergoing total cavopulmonary connection were selected as singleventricle group while 20 biventricle children of matching gender and age (±1 year) as biventricle group.Total bacterial DNA was extracted from stool samples of two groups and 16S rRNA gene was sequenced by highthroughput sequencing.Then the structural data of intestinal microflora were obtained.ResultsAt the level of operational taxonomic units,no significant intergroup difference existed in richness index (Ace:190.88 vs.201.28 and Cho:188.27 vs.201.90),diversity index (Shannon:3.140 vs.3.090 and Simpson:0.109 vs.0.110) and coverage index (coverage:0.999 vs.0.999) of gut microbiota (P>0.05).The predominant 4 phyla of intestinal microbiota were Firmicutes,Bacteroidetes,Proteobacteria and Actinobacteria.In addition,Cyanobacteria had significant intergroup difference (P<0.05).A total of 224 different genera of bacteria were obtained in two groups,among which Faecalibacterium (9.55% vs.14.91%),Veillonella (3.08% vs.0.50%),Lachnoclostridium (1.02% vs.2.12%),Roseburia (0.62% vs.2.51%),Bilophila (0.25% vs.0.05%) and Actinomyces (0.312% vs.0.008%) had significant intergroup difference (P<0.05).ConclusionNo significant difference exists in diversity index of gut microbiota between single and doubleventricle groups.However,the structure of intestinal microbiota has changed in some specific bacteria.

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更新日期/Last Update: 2018-08-21